高通量合成抗體工程技術平台
目前基於抗體的治療方法已成為全球生物製藥行業的主流,並展現了許多非常成功的案例。預計抗體生物製藥產業將在可預見的未來以前所未有的速度進一步擴張。我們已經建立一個具有創新潛力,可廣泛被生物製藥業中所有從事抗體相關生物製劑業者使用的技術平台,此技術平台以本實驗室開發之合成抗體庫(GH 抗體庫) 為基礎所建立。GH 抗體庫的基礎是基於電腦計算和生物資訊學研究,利用噬菌體展現系統將設計的抗體庫基因以核苷酸化學合成結合分子生物學技術進行展現。
技術優勢:
- 本技術平台為體外系統 - 應用噬菌體展現單鏈抗體庫作為抗體來源,毋須依賴動物免疫系統作為抗體來源。
- 本技術平台為單一框架之單鏈抗體庫 - 單鏈抗體庫變體建立在一個或幾個特性已被完整瞭解的可變結構區段上,因此其溶解度、穩定性和致免疫性等問題很少,可使用抗體庫內的單鏈抗體變體進行高通量功能篩選。
- 本技術平台可靶向動物免疫系統不易產生抗體的抗原決定位 (epitope) - 除了動物免疫系統之免疫顯性抗原決定位之外,本GH抗體庫之抗體變體可以靶向標的抗原上其它的抗原決定位:另外,當抗原對實驗動物具有毒性或對動物免疫系統有免疫耐受性時,適用本GH抗體庫進行抗體篩選。
- 本技術平台的抗體庫奠基於已知抗體抗原作用知識及循理設計(rational design) - 因此可應用物理化學原理與源自動物抗體之次世代定序及既有資料庫生物資訊分析結果,遵循抗體抗原作用原則及分析實驗結果迭代抗體設計。
- 本技術平台以化學合成抗體之抗原互補區塊基因 - 本技術平台之噬菌體展現抗體庫的抗原互補區塊基因是以化學合成的模板進行展現,可輕易地以高通量實驗測試抗體設計的合理性。
- 本技術平台具備超高的抗體庫複雜度 - 目前本技術平台具有超過 100個抗體庫,每個抗體庫含有至少十億個有功能的抗體變體,其總數可達1011以上,技術平台之設計可有效掌控運用此抗體庫集成之優勢核心技術。
- 本技術平台之GH抗體庫中所有6個抗原互補區塊皆具有編碼多樣性 - 本技術平台使用最小的引子組合(引子平均長度約70個鹼基,約100種DNA引子組合),在所有6個抗原互補區塊中引入特殊設計的簡併密碼組合。
- 本技術平台兼容所有抗原互補區塊之規範結構 - 抗體的CDRL1〜3和CDRH1〜2規範結構的組合是動物抗體結構與功能多樣性的基礎,CDRH3在胺基酸序列結構和長度的多樣性,更增添前述抗原互補區塊規範結構與功能的複雜度。
- 以深度測序 (deep sequencing) 進行品質管控 - 本GH抗體庫的品質控管使用次世代高通量定序來確保抗體庫建構的品質。
- 本技術平台是具有大量合成抗體庫的技術平台 - 單一合成抗體庫不足以包括靶向不同抗原和抗原決定位的所有功能性抗體,因此構建數以百計的抗體庫,每個抗體庫用於特定標的,使得此合成抗體庫集成作為新型抗體開發的技術平台基礎。
- 本技術平台可進行高通量篩選 - 本技術平台可以高通量程序進行抗體-抗原結合的篩選。
- 抗體建構的轉換及表現很容易 - 經由本技術平台所篩選得到的單鏈抗體可以很容易的轉換成IgG形式進行表現及純化,利於後續的研發與功能驗證。
- 本技術平台具有較低的抗體開發成本 - 本平台從載體構築、維持與操作等抗體研發過程中所需要的勞力與材料成本遠低於利用融合瘤技術研製單株抗體。
- 本技術平台所使用的單鏈抗體架構與雙特異性抗體的開發兼容 - 本技術平台所使用的單鏈抗體架構已被研究透徹,因此易於針對其穩定性及功能進行生物工程修改,使之成為應用於抗體醫療的雙特異性或多特異性抗體架構的基礎元件。
- 本技術平台高度相容於抗體藥物偶聯物的下游開發 - 本技術平台所使用的單鏈抗體架構能以高通量形式篩選抗體藥物偶聯物之候選抗體。本實驗室已針對GH抗體庫的抗體變異區段主體設計出專一性結合蛋白(AL1及AL2)測試系統,分別是AL1- 及 AL2-融合之螢光蛋白、毒蛋白或共價鍵結藥物,用以進行抗原抗體結合檢測或用於進行細胞毒殺測試。
- 本技術平台可使用最少的時間進行功能性IgG的開發 - 使用儲備的合成抗體庫集成進行單鏈抗體篩選所需要的時間通常少於兩週;從篩選到的候選單鏈抗體轉換成IgG形式生產純化需要2~4週,其所需時間取決於候選單鏈抗體的數目。因此當抗原製備可用後,從抗體篩選到完成約10個具功能性IgG的生產(毫克水平)所需要的總時間通常僅需一個技術純熟之工作人員4~6週的時間。
我們已經證明此GH 抗體庫技術平台能有效率地針對許多具有實際生物醫學意義之標的抗原產生新穎且獨特的功能性抗體;與國際上其它最新相關技術相比,本GH抗體庫技術平台在新穎抗體開發的許多面向都具有極大的優勢。因此,可預見的未來本GH 抗體庫技術平台將實現許多創新性的抗體研發工作,衍生自GH 抗體庫的抗體將會是應用於臨床治療或診斷人類疾病之創新解決方案的基礎。本GH 抗體庫技術平台將為正在開發治療用和診斷用抗體的許多其它商業和研究機構提供進一步的服務,最終由此技術平台所產生的生物製劑與相關技術將會成為未來新成立之產(商)業實體的基礎。